Enfeksiyondan 2 ila 21 gün sonra ortaya çıkan ilk Ebola semptomları ateş, yoğun halsizlik, eklem ve kas ağrısı, baş ağrısı ve larenjit, ardından kusma, ishal ve karın ağrısıdır. Beşinci günden yedinci güne kadar, lekeler ve küçük kabarcıklar ile karakteristik bir döküntü ortaya çıkabilir.
Hastalığın ilerlemesi ile birlikte karaciğer veya böbrek yetmezliği, pıhtılaşma sorunları ve gastrointestinal mukoza ve genital organların kanaması oluşabilir. Hastada virüsle savaşıp yenmek için genellikle 6 ila 16 gün vardır, aksi halde ciddi kanama ve kardiyovasküler çöküş ölümle sonuçlanabilir. Mortalite, Ebola virüsü suşuna ve verilen bakıma göre değişir.
