Patogenez, bir hastalığın gelişimini ve bununla ilişkili olaylar zincirini araştırır; bu, adım adım, etkilenen organlara ait hücrelerin ve dokuların morfosksiyonel değişikliklerini belirler. Bu değişikliklere kimyasal, fiziksel veya biyolojik ajanlar (virüs, bakteri vb.) Neden olabilir.
Etiyoloji nedenleri tanımlarken, patogenez sonuçlarını inceler.
Bu nedenle tıbbi metinleri okurken mikrobiyal patogenez, enflamatuar patogenez, viral patogenez, habis patogenez (bir hastalığın, genellikle tümörün, potansiyel olarak öldürücü hale gelinceye kadar giderek kötüleşmeye eğilimi) gibi terimlerle karşılaşabiliriz. Birçok hastalık farklı nedensel faktörleri (çok faktörlü etiyoloji) tanır ve daha da çok sayıda farklı evrim mekanizmaları (çoklu patogenez) ile karakterize olanlardır.
