Ebola virüsünün kökeni bilinmemektedir, ancak mevcut kanıtlara dayanarak, meyve yarasası patojenin doğal rezervuarı olarak kabul edilir.
Uçan tilkiler olarak bilinen meyve yarasaları, nehir ormanlarında yaşayan büyük yarasalardır. En az üç sağlıklı virüs içeren yarasa türü bilinmektedir (bu hayvandaki Ebola herhangi bir belirtiye neden olmaz): çekiç başlı yarasa (Hypsignathus monstrosus), Franquet'in omuz pedlerinden (Epomops franqueti) meyve yarasası ve meyve yarasası yakadan (Myonycteris torquata).
Fakat hayvanlardan kaynaklanan enfeksiyon insanlara nasıl geçti? Yıllarca süren iç savaşlardan kurtulmuş olan Afrika nüfusu için yarasalar bir beslenme kaynağıdır. Sadece bu değil. Ormansızlaşma için batılı ve Çinli şirketler ormana girip, mineral arayışı “ çalı-et ”, yani vahşi hayvanlardan elde edilen et ticareti ve tüketimini artırdı. Bu nedenle erkekler, yarasalar ( ara konakçılar ) tarafından enfekte edilen antilop veya şempanze yemek, Ebola virüsünü kapatabilir ve enfeksiyonu yayabilir.
