Toksoplazmozun fetüse geçme olasılığı, annenin enfeksiyonu geçirdiği gebelik dönemine göre değişir: Gebeliğin başlangıcında risk düşüktür ve zamanın ilerlemesiyle artar. Aksine, çocuğun bildirdiği hasarın ciddiyeti artar, maternal-fetal transmisyon ne kadar erken olursa ortaya çıkar. Hamileliğin altıncı ayı içinde daralmış enfeksiyon durumlarında, bir düşme meydana gelebilir, erken doğum veya doğumda fetus korrioretinit, hidrosefali (veya mikrosefali) ve intrakraniyal kalsifikasyonlar gösterebilir. Bu nörolojik bulgular döküntü, optik sinir atrofisi, nystagmus, sarılık, miyokardit ve zatürree ile ilişkili olabilir.
Toxo testi ile muhtemel ve doğrulanmış muhtemel toksoplazmoz durumunda, Toxoplasma gondii'nin gerçekten plasenta bariyerini geçip geçmediğini ve çocuğa bulaştığını bilmek için bir amniyosentezin uygulandığını belirtmek (hamileliğin 15. haftasından önce). Araştırma sırasında alınan ve PCR'ye (polimeraz zincir reaksiyonu) tabi tutulan amniyotik sıvı örneği, parazit DNA'nın varlığını doğrular, böylece fetal bulaşmayı teşhis eder. Öte yandan, ultrason izleme fetal hasar belirtileri gösterebilir (intrakraniyal kalsifikasyonlar, hidrosefali, hepatomegali, intrauterin büyüme geriliği). Doğumdan sonra, konjenital toksoplazmoz şüphesi, esasen serolojik araştırmalar ve özellikle tedavinin yokluğunda, yıllar sonra bile ortaya çıkabilen hastalık belirtilerinin varlığı ile doğrulanır.
